משאבת מים מיקרו, הידועה גם בשם משאבת מיקרו נוזלים, היא משאבת מים-מתחילה בגודל כיס-עצמית, המעבירה נוזלים בלחץ שלילי. הפרמטרים המרכזיים שלו כוללים ראש יניקה, קצב זרימה וראש פריקה. מבחינה מבנית, הוא מורכב מיחידת הנעה וגוף משאבה, עם כניסה ויציאה. נפחו קטן משמעותית ממשאבות מים קונבנציונליות. בהתבסס על מתח הכונן, הם מסווגים כ-AC או DC; בהתבסס על עקרון העבודה, הן מסווגות כמשאבות תזוזה חיוביות (המעבירות אנרגיה באמצעות שינויים בנפח תא העבודה), משאבות שבשבת (המסתמכות על האינטראקציה של שבבים מסתובבים עם מים), ומשאבות דיאפרגמה, בוכנה ומשאבות מונעות מגנטית, בין היתר. הסוגים הנפוצים כוללים את סדרת Zhongke Century (אורך חיים ארוך, עיצוב עמיד למים), משאבות מיקרו דיאפרגמה מוברשות DC ומשאבות מגנטיות ללא מברשות, המשתמשות בצירים קרמיים כדי להפחית רעש ולתמוך בהפעלת מתח רחב והתאמה אישית של פרמטרים.
ציוד זה מתאים להובלת מים, שמן וחומרי מאכל, והיישומים שלו מכסים מערכות קירור מים, מכשירים רפואיים (כגון עירוי תוך ורידי והמודיאליזה), קירור רכב, השקיה ביתית ומכונות קירור לייזר. מוצר טיפוסי הוא משאבת המים המיניאטורית VDP160, המשתמשת בעקרון המשאבה הפריסטלטית, בעלת הרמת יניקה של 9 מטר, קצב זרימה של 0.15 ליטר/דקה וגובה של 23 מטר ועמידה בפני זיהומים. בעת בחירת משאבה, יש צורך להתאים את המתח, המאפיינים הבינוניים ודרישות הראש, תוך מתן תשומת לב לצריכת אנרגיה ותחזוקה-לטווח ארוך, ולתעדף חומרים ומבנים עמידים בפני קורוזיה- בעלי תכונות איטום חזקות. משאבות DC יעילות ביותר אך דורשות הגנה מפני ריצה יבשה; למשאבות מגנטיות תוחלת חיים ארוכה אך הן יקרות יותר; דגמים מסוימים משתמשים בחומרים מרוכבים מפלסטיק-אלומיניום, המשלבים עמידות בפני קורוזיה ומאפיינים קלים.